1952年，紫连山林校并入皖北高级农林学校。
1952年，学校更名为凤阳农业学校。
1960年，凤阳农业学校升格为凤阳农业专科学校。
1960年，安徽农业专科学校（1958年创建）、芜湖农业专科学校、屯溪茶叶专科学校、宿县农业专科学校等3校的农学专业并入凤阳农业专科学校。
1965年，安徽农学院（牧医系、院直机关）、凤阳农业专科学校合并组建安徽农学院（凤阳分院）。
1981年，安徽农学院（淮北分院）并入安徽农学院（凤阳分院）更名安徽农学院（皖北分院）。
1981年，安徽农学院（皖北分院）升格为皖北农学院。
1985年，皖北农学院改建安徽农业技术师范学院。
2000年，安徽农业技术师范学院更名为安徽技术师范学院。
2009年，获批为安徽省示范应用型本科高校立项建设单位。
2012年，被教育部授予“全国毕业生就业50所典型经验高校”称号。
2013年，作为教育部遴选的全国首批本科教学审核评估试点单位接受了审核评估工作，受到评估专家的高度评价。 获批为首批安徽省高等教育振兴计划。 10月，获首届中国草业科技奖。
2014年，安徽科技学院获批为首批全国卓越农林人才教育培养计划项目试点高校。